吴毅臻是上海申花上赛季重点引援，球队引进他时可是花了大价钱。在老申花球迷眼中吴毅臻的踢球特点，很容易让他们想起申思。吴毅臻和申思一样都是身体对抗一般，靠脑子在中国足坛立足。只是吴毅臻没有申思那么好的运气，申思能在刚出道时就在申花站稳脚跟。还得感谢名帅徐根宝掀起的青春风暴。申思和祁宏两位毛头小伙子，就在申花开始获得稳定的出场时间，并且迎来职业生涯巅峰。
吴毅臻刚出道时效力于上海上港，他在球队效力时间并不长。2013赛季吴毅臻就获得了一次出场机会，出场时间仅为24分钟。眼看着自己在上港板凳席上就要被荒废，吴毅臻就想着走出去看看。正好上海申鑫经过全面考察之后，选定了吴毅臻。申鑫是崇尚技术流的球队，对于技术出色的球员向来是情有独钟。另外申鑫本身经营状况一般，在本土转会市场上只能引进吴毅臻这样在中超豪门踢不上主力的潜力新星。事实证明吴毅臻加盟上海申鑫就是一个正确选择，因为他在申鑫表现可圈可点，迎来了职业生涯一个巅峰。2015赛季中超是吴毅臻个人生涯表现最好的一个赛季，这个赛季他为申鑫打入了4个进球。并且贡献了3次助攻。
只可惜吴毅臻在申鑫表现最好的一个赛季，却遭遇了球队降级的打击。上海申鑫在2015赛季战绩不佳，降级到中甲。吴毅臻为了报答申鑫的知遇之恩，在球队坚守了两个赛季。可能吴毅臻觉得以申鑫实力分析，应该可以很快完成冲超任务。然而上海申鑫降级到中甲之后，就没想过要冲超。申鑫在中甲小富即安的生存策略，让当打之年的吴毅臻只能踢中甲。
直到上赛季吴毅臻才被慧眼识珠的上海申花买走，吴毅臻觉得自己能加盟申花，就是他职业生涯重大突破。作为土生土长的上海人，吴毅臻肯定是有很浓重的申花情结。所以他在加盟申花之后，一直在比赛中踢得非常卖力气。只是吴毅臻没有在申花坐稳主力，他所踢得左前卫和前腰两个位置，申花并不缺人。吴毅臻在申花如果踢左前卫，他面临的是跟曹赟定竞争。曹赟定是申花雷打不动的左前卫主力，吴毅臻只能给他打替补。
申花前腰位置基本上由外援垄断主力，让吴毅臻同样看不到出头希望。所以吴毅臻在加盟申花初期踢了一段时间主力之后，他很快陷入了职业生涯低谷。吴毅臻在申花后期彻底沦为替补，让他在本赛季无缘球队中超一线队大名单。吴毅臻为了摆脱在申花连球都踢不上的命运，就决定离开申花加盟武汉三镇。这位昔日被视为申花本土指挥官的球员，本赛季沦落中乙联赛，让很多球迷都感到非常惋惜。吴毅臻在中乙武汉三镇表现不俗，有传射俱佳的表现。希望他好好表现，早日迎来职业生涯又一个巅峰。
